近期,中国科学院微生物研讨所的吴边团队经过运用人工智能核算技能,构建出一系列的新式酶蛋白,完成了天然界未曾发现的催化反响;并在世界上初次经过彻底的核算辅导,取得了工业级微生物工程菌株,取得了人工智能驱动生物制作在工业化运用层面的首先打破。效果宣布在学术期刊《天然·化学生物学》杂志上。
该项研讨不只下降了传统化学组成中对反响条件的严苛要求,更重要的是处理了化学组成带来的污染问题。这是人工智能技能在工业菌株规划方向的成功事例,验证了其科学理论根底,也将为人工智能与传统生物工业的互作交融翻开新局面。
现代生物制作现已成为全球性的战略性新式工业,在化工、资料、医药、食物、农业等许多严重工业范畴得到了广泛的运用,依据OECD猜测,到2030年约有35%的化学品和其他工业产品来自生物制作。欧、美、日等首要发达国家都将绿色生物制作确立为战略展开要点,并别离拟定了相应的国家规划。我国正处于建造立异式国家与加快生态文明体制改革的决议性阶段,紧随并引领世界科技前沿,展开新式绿色生物制作技能,支撑传统工业晋级革新,关乎资源、环境、健康,契合国家严重战略需求。
近年来,人工智能技能迅猛展开,其影响开端推行到绿色生物制作范畴,尤其是在其中心元件蛋白质的规划方面,发挥了巨大的效果。经过人工智能技能,猜测蛋白质结构、规划蛋白质功用,可以极大地扩展人工改造生命体的运用场景,革新性地推动绿色生物制作的展开。蛋白质的工程改造正在阅历了从传统试验进化到核算机虚拟规划的演化进程,核算机辅助蛋白结构猜测以及新功用酶规划战略得到了史无前例的注重和展开,成为了生物学、化学、物理学、数学等多学科穿插的热门前沿范畴。
酶是生物催化技能中的中心“发动机”,其本质是一种蛋白质。蛋白质的生物学功用很大程度上由其三维结构决议,结构猜测是了解酶功用的一种重要途径。《科学》杂志将蛋白质折叠问题列为125个最为严重的科学问题之一。
近年来,跟着核算机科学、核算化学、生物信息学等多学科的联合前进,这一问题的处理看到了曙光。尤其是在CASP比赛推动下,蛋白质结构猜测办法和新功用酶核算规划战略得到了迅猛的展开。
规划蛋白质一方面可以提醒蛋白质结构与功用联络的规则,另一方面可以发明具有潜在运用价值的蛋白质。2016年,《天然》杂志宣布了题为《全新蛋白质规划年代降临》的重要总述。同年,《科学》杂志也将蛋白质核算机规划遴选为年度十大科技打破之一。2017年,美国化学会将人工智能规划新式蛋白质结构列为化学范畴八大科研展开之首。多个来自美国、瑞士等国的科研团队活泼在这个范畴,文章宣布在《天然》、《科学》等尖端学术期刊上。
现在,全球微生物酶制剂商场首要由几家跨国企业独占。与之比较,国内企业在商场竞赛中依然处于晦气的方位,以大宗一般微生物催化剂(如淀粉酶、糖化酶)为主,职业呈现出竞赛白热化的态势。但我国现已注意到这个问题,并着力改进。2017年5月,《“十三五”生物技能立异专项规划》在坚持立异展开、着力进步展开质量和效益层面,提出拓宽工业展开空间、支撑人工智能技能等具有严重工业革新远景的颠覆性技能展开要求。
在此规划的指引下,我国的多个研讨团队在该范畴取得了不俗效果。例如,中国科学院微生物研讨所的吴边团队经过人工智能核算技能,赋能传统微生物资源,在世界上初次完成了工业级工程菌株的核算规划,取得人工智能驱动生物制作工业化的首先打破。该团队不只规划了β-氨基酸这一类具有特别生物活性的非天然氨基酸的最优组成途径,还凭借人工智能核算手法,成功规划出一系列的β-氨基酸组成酶,并据此构建出可以高效组成β-氨基酸的工程菌株。
不只如此,微生物研讨所还活跃推动效果的落地转化。经过与企业的协作,现已建成千吨级的出产线,相关产品潜在商场规模超越30亿,有望在紫杉醇、度鲁特韦与马拉维若等抗癌与艾滋病医治药物的出产进程中大幅度下降出产成本。中国科技大学的刘海燕团队则提出了一种新的计算能量模型,为树立具有高“可规划性”的蛋白质主链结构供给了可行性处理方案。2017年,该团队与中科院脑科学与智能技能杰出立异中心杨弋团队协作,规划出了新一代细胞代谢荧光蛋白质探针,并将其运用于活体动物成像与高通量药物挑选,相关效果宣布于《天然·办法学》。
除此之外,中国科学院天津工业生物技能研讨所的江会锋团队,经过运用人工智能技能进行要害组成酶的开掘,在世界上初次完成了重要中药活性成分灯盏花素的人工生物组成,相关效果宣布于《天然·通讯》,引起强烈反响。
展开人工智能规划元件的中心算法与战略研讨。人工智能技能运用于生物制作范畴最为根底的部分是中心算法与规划战略的发明。考虑到根底研讨的难度与特色,主张选拔一批在该范畴的优秀科学家,供给相对安稳的支撑,让他们潜心研讨、长时间攻关、完成更多原创发现,提出更多原创理论,拓荒更多范畴展开方向。将人工智能技能与蛋白质结构与功用理论、组成化学理论、量子化学理论有机穿插交融,展开新式算法,树立“高可规划性”系统战略,把控底层中心技动力头,力求完成人工智能要害技能驱动生物制作的世界领跑位置。
拓宽人工智能规划元件在生物制作范畴的运用场景。在展开算法的根底上,我国还应活跃推动人工智能规划在生物制作范畴的运用拓宽。主张由优势单位安排严重项目,协同全国相关单位联合攻关;展开系统、科学的新式化学运用拓宽战略,使用新式生物催化反响改造和优化现有天然生物系统,从头创立组成可控、功用特定的人工生物系统,在发明研讨东西和技能办法的根底上,推动化学、生物、资料、农业、医学等多学科的实质性穿插与协作,为天然化学品与有机化工原料脱节对天然资源的依靠,促进可继续经济系统构成与展开奠定科学根底,全面提高我国生物制作工业的中心竞赛力。
推动人工智能驱动生物制作技能的工业展开。立异驱动展开战略需求履行立异效果,发明新的经济增加点。人工智能驱动的生物制作技能的终究价值也应该体现在实实在在的工业活动上,假如没有与上下游的杰出生态,再超卓的技能或产品也只能是死路一条。主张在技能展开与商场需求的耦合驱动下,坚持产学研多方位的敞开联合,消除效果转化进程履行层面依然广泛存在的种种屏障;注重本钱关于技能和工业展开的催化效果,探究树立专项工业展开基金等商场调控手法;在国家层面,和谐交流职业监管组织,破除不达时宜的陈腐方针约束,赶快树立有利于新式生物技能的方针法规系统;完成资源、动力的节省与代替,加快改变经济增加形式,加快推动绿色与高效低碳生物经济的工业根底格式。
(中国科学院微生物研讨所副所长、微生物资源前期开发国家要点试验室主任向华)
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